O equilíbrio para alelos múltiplos 

A distribuição genotípica em repouso, quando se envolve genes com freqüência p, q, r…, será definida pela seguinte fórmula:

(p + q + r… + n)² 

Se caso houver três genes A, a¹ e a², com as freqüências relativamente idênticas a p, q, e r, será usado (p + q + r)², que quando se propagar teremos: p² + q² + r² + 2pq + 2 pr + 2qr.

Veja como isso se dá no quadro abaixo: